Las zonas húmedas presentan un carácter notable para el territorio del parque esencialmente kárstico y dónde el agua circula en profundidad. La fauna y la flora de estos medios son particularmente raras para el Parque y el departamento del Lot (Helecho de las marismas, Rascón común…).
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La marisma de Bonnefont ha obtenido la clasificación de Reserva natural Regional. Se trata del reconocimiento al trabajo efectuado para salvaguardar y valorizar el sitio desde hace muchos años por la Comunidad de municipios de la región de Padirac, gestor, y el Parque, socio privilegiado de dicha gestión.
El Parque también trabaja con las asociaciones y las colectividades locales en los dos otros medios naturales, los Estanques de Puy Blanc y el Lago de Bannac.
